法镜寺是“天竺三寺”中的下天竺寺，在天竺三寺中，法镜寺规模最小，但历史最久，距今已有一千六百余年，是杭州唯一之女众寺院。

法镜寺在清咸丰十一年（1861）在兵火中化为灰烬，光绪八年（1882）再次重建。1949年前，寺宇因年久答修，大部分建筑破损甚多。1950年后，部分较完整建筑移作中药材仓库。1958年左右改作工厂。1982年，杭州市佛教协会组织重建，至1989年底，寺内中轴线上三大殿等殿堂修整一新，49尊佛像全部贴金。其中药师殿内药师如来坛，按《药师经》仪规设计塑成，造型别具一格，堪称传统佛制，为国内仅有。1989年10月20日，隆重举行药师佛开光仪式。